Wie schon erwähnt, pack den Footer in einen eigenen container_12, dem kannst du die Hintergrundfarbe geben. Verzichte auf die Klassen alpha und omega, die sind für deine Zwecke nicht relevant. Schau dir nochmal den grundlegenden Aufbau des 960er-Grids an, dann siehst du recht schnell, was du wie einbinden musst.
960 Grid System — Demo
Und lass mal die ganzen leeren Divs weg, welchen Zweck sollen die denn erfüllen?