Sicher hat top Auswirkungen. Es kommt natürlich auch darauf an, ob die position: für das Element korrekt gesetzt ist.

Fraglich ist, warum du ein div unbedingt um 50% nach oben verschieben willst, vielleicht gibt es ja eine bessere Lösung für dein Problem. Wenn du dein Problem also einmal erörtern könntest wäre das sehr hilfreich für uns.